В отделението се извършва диагностична дейност чрез макроскопско и микроскопско изследване на заболели органи, тъкани и клетки на потърсилите медицинска помощ.
Въпреки че работата на патолозите се свързва предимно с извършване на обдукции (аутопсии) на починали, това е само малка част от работата на патолозите (патоанатомите). Близо 90% от диагностичната работа е ангажирана с прижизнена диагностика на пациентите с цел провеждане на адекватно лечение.
Като база на Медицинския факултет на СУ “Св. Климент Охридски” отделението развива обемна преподавателска и научна дейност.
В съответствие с утвърдения за страната медицински стандарт за „Клинична патология“ в отделението се осъществяват следните дейности:
Отделението е акредитирано като база за обучение на студенти на СУ “Св. Климент Охридски” – Медицински факултет по дисциплината “Патоанатомия и цитопатология” и обща и клинична патология за специалността “Медицина” – образователно-квалификационна степен “Магистър” – III и IV курс и на специализанти по “Обща и клинична патология”. Обучават се и студенти по Медицинска рехабилатация и ерготерапия и медицински сестри, както и магистър-биолози.