Отделението е оборудвано със съвременна апаратура за извършване на горна и долна гастроинтестинална фиброендоскопия, фибробронхоскопия и различни ендоскопски манипулации, а в кабинета по ултразвукова диагностика се извършват изследвания на коремните органи, щитовидната жлеза, Доплер-диагностика, както и манипулации под ултразвуков контрол.